Neben seiner Arbeit an der neuen Version der Bibel und verschiedenen Übersetzungen verfasste Eznik von Kolb mehrere Werke, von denen das wichtigste seine bemerkenswerte apologetische Abhandlung "Wider die Irrlehren" ist. Es wurde zwischen 441 und 449 geschrieben und besteht aus vier Teilen: Im ersten, "Gegen die Heiden", bestreitet Eznik die Ewigkeit der Materie und die substantielle Existenz des Bösen. Im zweiten widerlegt er die Hauptlehren des Parseeismus/Zoroastrismus, insbesondere den Zurvanismus. Der dritte Teil richtet sich gegen Aspekte der Glaubensvorstellungen der griechischen Philosophen (Pythagoräer, Platoniker, Peripatetiker, Stoiker und Epikureer). Dies ist der einzige Abschnitt, in dem Eznik seine Argumente aus der Bibel und nicht aus der Vernunft bezieht. Das vierte Buch ist eine Darstellung und Widerlegung des Marcionismus als einer dualistischen Häresie. Ein wesentliches Thema des Werkes ist die Bedeutung des freien Willens in der christlichen Theologie.
